磁界の検知方向が異なります。センサの真上に磁石があるとき、磁石のNSの向きを垂直に置くのがホールIC配置。水平に置くのがAMRです。
磁石のN・S極付近は磁力が強いため、近くにクレジットカードなどの磁気データがあるとカードのデータに影響することがありますのでスマートフォンやノートPCなどの電子機器で磁石を垂直方向に置けない場合はAMRが有利になることがあります。（水平配置だと磁気データが消失しないということではありません。）
磁石の位置が大きく変更できないとき、AMRセンサは磁力線の向きでOFFすることができます。これを利用して極めて短いストロークのスイッチ、回転検知などへの応用ができます。
詳細は、AMRセンサ（磁気センサ）他方式との違いをご覧ください。
磁気センサ 基礎知識ー AMRセンサ（磁気センサ）とホールICの違い